发表Nature等杂志四十多篇论文老师带您学单细胞测序数据挖掘分析和课题设计 2020年2月22-23日 北京

原标题:发表Nature等杂志四十多篇论文老师带您学单细胞测序数据挖掘分析和课题设计 2020年2月22-23日 北京

两天一夜高强度训练,理论与实战相结合

赠送高清视频供学员复习使用

赠送电子版讲义,老师在群里做答疑服务

授课老师

长期从事单细胞多组学方面的项目研究,发表Nature 等杂志四十多篇论文,目前承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题

会务背景

单细胞测序技术作为科研领域最新、最热的技术,发展神速。好的技术给科研带来了更为丰富、精准的数据。如何在最终的数据分析中结合生物学背景挖掘到更多信息也是困扰很多科研人员的一大难题。为了让更多的研究者了解单细胞测序数据挖掘的常用套路以及单细胞常用数据分析软件的使用特举办单细胞测序数据挖掘与课题设计学习班。

课程目标

1、了解单细胞测序基本概念及原理

2、了解单细胞测序分析的常用软件

3、掌握单细胞测序数据的下载方法

4、掌握单细胞测序数据的研究思路

5、学会R语言基本语法和绘图技巧

6、学会用R代码进行单细胞转录组分析并作图

7、熟悉CNS杂志单细胞转录组文章思路

8、熟悉零成本的单细胞相关课题设计思路

9、获得全套全自动化分析单细胞数据的流程脚本

课程特色

理论和实战相结合

两天一夜的高强度训练,无需基础,配套操作视频慢慢回顾和复习。

代码方面

老师为大家提供了一套流程化的代码,您“傻瓜式”运行即可得到想要的一套分析结果和图表。

授课老师

老师经验丰富,现场授课得到所有的学员认可和好评。

内容设置

第一天上午8:30-11:30 单细胞测序技术与应用 1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍。2. 单细胞测序技术在科研领域的应用。3. 近年单细胞技术 CNS文章思路解析。4. 单细胞文章常见图表解读5. 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及植物等领域的研究内容及思路。 理论
第一天下午1:30-17:00 Linux R语言入门实操 1. 常规基础Linux命令入门讲解及实操训练。2. R 语言简介及安装,RStudio的安装及使用说明。3. R 语言语法介绍及常用命令。4. 数据处理功能及统计应用。5. R 语言画图实操tSNE ,小提琴图,热图,网络图,GOKEGG富集图,GSEA等图形绘制。 实操
第一天晚上18:00-21:00 单细胞转录组数据分析思路及流程 1. 单细胞高分文章分析思路解析(细胞类群确定拟时间分析差异表达、通路富集转录因子、配体受体互作等2. 单细胞转录组比对定量分群及拟时间分析等软件及参数。3. 单细胞转录组转录因子功能通路配体受体互作思路解析。4. 单细胞组学分析常用数据库介绍及使用。5. 基因富集分析和可视化。 理论
第二天上午8:30-11:30 单细胞数据可视化、细胞分型及 marker鉴定 1. 10X 官方单细胞软件Cellranger讲解及实操。2. 从基因表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操。3. 通过Seurat软件进行PCAtSNE降维。4. 单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析。5. 通过SeuratGSVA等进行单细胞转录组差异分析。 实操
第二天下午1:30-17:00 单细胞数据轨迹分析,功能富集 1. 通过Monocle软件进行单细胞转录组拟时间分析。2. 通过DAVIDmetascape网站进行通路富集分析。3. 单细胞数据分析总结。4. 归纳总结零成本单细胞数据挖掘思路。5. 单细胞测序基金申请思路、准备内容及注意事项等。 理论+实操

【时间地点】

2020年2月22-23日 21日报到

北京宝林轩酒店

【住 宿】

(没有强行规定,可以自订酒店,住宿费用自理)

北京宝林轩酒店(含早)400元/间、、

合住的学员最后出现单人无法安排的情况,需要自补房间差价。

【注册费用】

3400元/人。授课期间发放纸质邀请函(盖章)和发票。按交费先后顺序确定座位号。会务期间提供午餐,晚餐自理。

其他课程安排,

2.7-9 上海 2020 基金标书专家一对一辅导会
2.15-16 北京 临床研究设计、统计分析与文章发表
2.15-16 北京 DNA RNA甲基化数据分析与课题设计学习会
2.22-23 北京 单细胞测序数据挖掘、分析与课题设计学习班
2.22-23 北京 Meta 分析和网状meta分析
2.29-3.1 上海 影像组学应用与 SCI论文写作学习会
2.29-3.1 上海 CRISPR/Cas9基因组编辑技术( 动物、植物、斑马鱼)
3.7-8 上海 外泌体研究与实验技能学习会
3.7-8 上海 肠道菌与代谢课题设计 ,研究方法与SCI论文写作
3.6-8 上海 科研论文插图 /数据处理和图表制作学习班
3.14-15 上海 不做实验,不写 meta分析发SCI论文
4.10-12 上海 “万用模版” SCI英文论文写作法
4.17-19 上海 临床科研设计与数据管理
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