关于如何绘制这篇Science文章的高颜值组合热图（如下图），我写过两篇教程。其中一篇主要介绍了基于R语言的绘制方法，感兴趣可阅读 《绘制一篇Science的组合图》 一文；而另一篇 《如何绘制漂亮的Science组合图？》 则介绍了如何用Ai(Adobe illustrator)绘制这样的美图。
（ Science , 2015）
这两种方法需要有一点R语言基础或者会用Ai这款软件，这对于小白来说都太难了。今天，为大家推荐一个在线小工具，只需上传数据就可以轻松绘制上图这般精美的组合图！
这个工具就是OmicShare 新上线的动态网络热图工具，另外，在谷歌学术搜索“OmicShare”可发现，已有1590篇文章引用OmicShare。下面就以 《绘制一篇Science的组合图》 一文的范例数据为例看下如何绘制这样的组合图吧！
工具链接：
https://www.omicshare.com/tools
1. 数据准备
首先，需要准备2个表格，分别用来绘制右上方的相关性热图和左下方的网络图。第1个表格为环境因子之间的相关系数矩阵，如下。相关系数矩阵的计算可使用OmicShare的4个相关性计算工具。
第2个表格为不同分组的微生物丰度与环境因子的相关性（Mantel test）系数r值和p值表格，如下。
数据准备好后，依次点选择文件按钮，在弹出的选择文件窗口点本地文件按钮，上传刚才准备好的2个表格文件，如下图。如果数据需要反复使用，可将表格上传到我的数据，作图时直接选择使用云端数据。任务编号会随机生成，点击提交按钮，到我的任务页面可以查看任务状态，大约5秒左右刷新任务状态即可，然后点跳转查看。
需要注意的是，对于OmicShare所有的小工具，大家都可以点击示例文件，进入范例数据页面。也可将数据下载下来，然后上传示例文件用于作图练习。
2. 参数调整
点击刷新任务状态按钮，可查看初始绘制效果，也可以切换到其他的任务编号，查看之前的分析结果。初始结果已经很漂亮了，接下来点击设置按钮，在全局修改选项下修改图表的标题、字号、字体大小等，方法如下。
在方格修改选项下，可以设置方格的边框颜色（这里设为橙红色），还可对热图的配色进行自定义调整，如下。除了默认的4种配色，每种配色中的颜色（色号）都可以自定义修改。
在线条修改选项下，我们可以将线条的粗细、颜色与相关性系数r值（或p值）建立映射关系（映射范围的边界值可以自定义），也可以修改不同线条的颜色和粗细值。
此外，如果看腻了方形格子的热图，也可以通过修改方格形状将格子改为圆形。
调整后的效果如下：
4. 图片导出
调整满意后，设置图表的宽度和高度，点下载按钮下载图片，如下。OmicShare tools支持下载svg格式的矢量图，便于后期在Ai(Adobe illustrator)中调整，或直接在word、PPT中使用。
最终导出图片的效果如下（网格线我改回了中性的黑色）：
虽然说调整到这里效果已经很不错了，但还达不到我的标准。比如我这里导出SVG格式图片后使用Ai进性了进一步美化，主要对分组标签的位置做了调整，并将连线两端的结点置于顶层，修改了结点、图例中短线的填充颜色，如下图。当然，这些点也是OS工具接下来可以优化的地方。
最终的效果如下：
好啦，今天的内容就先分享到这里，如果想学习科研图表的美化调整，可以了解下基迪奥最新推出的绘图工具书， 详情→戳这里 ~
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参考资料
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Sunagawa S, Coelho L P, Chaffron S, et al. Structure and function of the global ocean microbiome[J]. Science, 2015, 348(6237): 1261359.
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