医学微生物组研究不仅对提升人类健康水平有直接贡献，也对生命科学的整体发展产生了重大影响，是医学研究和临床实践的一个重要方向。美格基因于5月17日正式上线系列医学服务产品，涵盖医学微生物组、医学转录组以及医学代谢组等组学产品，其中微生物组学作为一门探究微生物群体与其宿主相互作用的科学，对医学和健康领域有着至关重要的作用。此次上线的医学微生物组系列产品（微生物多样性和宏基因组二代）与我们的常规微生物组产品存在哪些不同之处呢，一同来瞧瞧吧。
首先在了解上线的医学微生物组产品与常规微生物产品不同之处前，我们先来了解一下它们的定义吧。
微生物组（Microbiome）：指特定环境（如人体、土壤、水体等）中所有微生物（包括细菌、古菌、真菌、病毒和原生生物等）及其遗传物质（基因）的总称。它强调的是一个生态系统中所有微生物作为一个整体的功能和相互关系。
医学微生物组：指生活在人体内外的微生物总称，包括细菌、病毒、真菌等。这些微生物与人体之间存在着复杂的相互作用关系，对人体健康有着重要的影响。医学微生物组研究主要集中在人体肠道微生物组、皮肤微生物组、口腔微生物组等方面，通过深入研究微生物组的组成、数量、功能等方面，可为疾病预防、诊断和治疗提供新的思路与方法。
常规微生物组：指非医学领域所研究的微生物组，例如环境微生物组（如土壤、水体、空气等）、工业微生物组（如发酵工业、生物能源生产等）或者农业微生物组（如根际微生物、土壤改良微生物等）。这类研究可能关注的是微生物在特定生态系统中的功能、生态服务、生物地球化学循环等方面的作用，而非直接与人类健康或疾病相关。
一、医学微生物组和常规微生物组的比较
医学微生物组和常规微生物组在研究目的、研究对象、应用范围等方面均存在差异，主要的区别如下表所示：
表1. 医学微生物组和常规微生物组的比较
二、美格基因医学微生物组产品亮点
1. 新增人体口腔微生物数据库（eHOMD）
人体口腔微生物数据库（eHOMD，The Human Oral Microbiome Database, https://www.homd.org/）是一个专注于人类口腔微生物组的专业数据库。该数据库旨在收集并分类在人类口腔中发现的各种微生物的基因组信息，包括细菌、真菌、病毒以及其他微生物如螺旋体、支原体和原虫等。eHOMD不仅提供了详细的微生物分类信息，还包括它们的生理特性、生态分布以及与人类健康和疾病的关联。基于医学微生物多样性和宏基因组（二代）测序数据，进行eHOMD数据库注释，扩展微生物物种注释范围。
2.医学样品处理流程优化
常规微生物组检测样品类型主要是土壤、水体、空气、沉积物等环境样品，相关样品处理依然极为成熟。然而医学样品如粪便、肠道、体液、组织等，鉴于医学研究的严谨性，特别是部分医学样品具有传染性，且容易受到环境污染等情况，所以其在实验环境、样品处理等方面相较于常规微生物组有着更为严苛的要求。针对相关的医学样品，我们对实验条件及样品处理进行了进一步优化，施行更严格的标准，以确保数据质量。
3.更适配医学分析点
此次上线的医学微生物组、医学宏基因组（二代）产品，在常规数据库注释和分析上均适配医学注释和分析。由于医学样品存在微生物组占比较低的情况，因此医学宏基因组（二代）分析流程中添加了去宿主数据分析，针对去除宿主后的数据进行后续多样化的分析。主要分析流程如下所示：
图1. 微生物多样性（医学）分析流程图
图2. 宏基因组（二代）医学分析流程图返回搜狐，查看更多